应用UV-X-IP分析酿酒酵母HSF和靶DNA的相互作用

Analysis of Yeast Heat Shock Factor-Target DNA Interactions by UV-X-IP

DOI：

中文关键词: 紫外激光交联 免疫沉淀 酿酒酵母 热激因子 靶DNA 应用 分析 酿酒酵母 相互作用 Interactions Heat Shock Yeast 共价结合 紫外激光 扩增产物 样品 富集 发现 结果 免疫沉淀 设计 编码区 启动子区 基因组 片段化

英文关键词:

基金项目:陕西省教育厅资助项目

刘开辉 丁小维 邓百万 陈文强 张乐民

[1]陕西理工学院陕西省资源生物重点实验室,陕西汉中723001 [2]云南大学云南省生物资源保护与利用重点实验室,云南昆明650091

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中文摘要:

利用紫外激光交联和免疫沉淀技术(UV laser crosslinking and immunoprecipitation, UV-X-IP)分析原核表达的酿酒酵母热激因子(heat shock factors,HSFs)和片段化的基因组靶DNA的相互作用.分别在ScSSA1、ScSSA4启动子区和编码区设计引物对免疫沉淀的DNA 进行PCR分析.结果发现,紫外激光交联和免疫沉淀DNA库中富集了ScSSA1、ScSSA4启动子区HSF结合的DNA片段,而没有编码区DNA,表明HSF特异结合了靶DNA.从未经紫外激光交联样品的免疫沉淀DNA库中未获得相应PCR扩增产物,说明紫外激光在酿酒酵母HSF与靶DNA之间形成共价结合中起重要作用.

英文摘要:

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