皂苷类似物与肾素的分子对接和结合能分析

Molecular Docking of Saponin Analogues with Renin and The Analysis of Binding Energy

DOI：10.3969/j.issn.1673-1689.2014.10.008

中文关键词: 肾素 大豆皂苷I 分子对接 动力学模拟 结合自由能

英文关键词: renin,soyasaponin I,molecular docking,dynamics simulation,binding free energy

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中文摘要:

肾素是治疗高血压疾病的重要靶标之一，对肾素抑制剂大豆皂苷I及其类似物大豆皂苷II、甘草皂苷、单葡萄糖醛酸甘草皂苷元与肾素进行分子对接，采用分子动力学模拟和MM-PBSA相结合的方法计算对接复合物的结合自由能，并且对各部分贡献能以及分子间相互作用进行分析。结果表明范德华力和静电相互作用是复合物形成的主要驱动力，S2和S3是肾素和皂苷相互作用重要的活性口袋，Ala229、Asp38、Asp226、Gly228和Tyr83是肾素中与这类抑制剂形成疏水作用的重要氨基酸残基，Ser230、Tyr231、Ser84则

英文摘要:

Renin is one of important targets for the treatment of hypertension. Soyasaponin I and its analogues soyasaponin II，glycyrrhizin and monoglucuronyl glycyrrhetinic（MGGM） were docked with renin，and binding free energy was calculated using molecular dynamics

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