用氨基酸组分预测含顺式肽键蛋白质

Predicting Proteins Containing Cis Peptide Bonds Using Amino Acid Compositions

DOI：

中文关键词: 顺式肽键,氨基酸百分含量,蛋白质二级结构,统计关联

英文关键词: cis peptide bond,amino acid composition,protein secondary structure,statistical correlation

基金项目:工业生物技术教育部重点实验室访问学者基金项目资助课题.

宋江宁 李炜疆

江南大学工业生物技术教育部重点实验室，江南大学工业生物技术教育部重点实验室 江苏无锡214036，江苏无锡214036

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中文摘要:

以含有820个蛋白质结构数据的SLCTBASE数据库作为样本库,根据蛋白质序列氨基酸百分含量与顺式肽键的关联信息,构建了基于序列整体氨基酸含量的顺式构象势函数.利用此函数拟合得出的20种氨基酸的顺式构象因子值,进行两类蛋白质序列的分类和预测.训练集和测试集相同时和不相同时的预测准确率分别可达66%和64%.

英文摘要:

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