代谢网络自动绘制的快速网格布局算法

A Fast Grid Layout Algorithm for Automatic Drawing Complex Metabolic Network

DOI：

中文关键词: 代谢网络 网格布局算法 绘图 可视化

英文关键词:

基金项目:国家高技术研究发展计划(863计划)，江苏技术师范学院青年科研基金

何胜 梅娟 石贵阳 王正祥 李炜疆

[1]江南大学生物工程学院,江苏无锡214122 [2]江南大学工业生物技术教育部重点实验室,江苏无锡214122 [3]江苏技术师范学院计算机科学与工程学院,江苏常州213001

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中文摘要:

描述众多代谢物之间的拓扑关系的代谢网络,是抽象的高维数据.为了帮助人们分析这些复杂的数据,需要开发高效的可视化算法.近年来日益引起关注的网格布局算法在代谢网络自动绘图中显示了很好的特性,其面临的一个主要问题是如何有效降低计算量以满足快速、准实时网络绘图的需求.作者提出了一种快速网格布局算法,采用邻域试探和扰动再优化的全局搜索策略,能够数秒内产生高质量的典型代谢网络布局,适用于更广泛的代谢网络可视化分析应用.

英文摘要:

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