基于形态特征和ITS序列分析秦巴山区黑木耳主要栽培种的亲缘关系
来源:     发布日期:2020/06/05 15:54:56  浏览次数:

基于形态特征和ITS序列分析秦巴山区黑木耳主要栽培种的亲缘关系

Analysis of the Genetic Relationships of Main Auricularia auricular Cultispecies in Qinba Mountainous Area Based on ITS Sequence

DOI:10.3969/j.issn.1673-1689.2014.05.014

中文关键词: 黑木耳 菌丝 生长速度 ITS序列

英文关键词: Auricularia auricular, mycelia, growth rate, ITS

基金项目:

作者

单位

王进

陕西理工学院 生物科学与工程学院陕西 汉中 723000

陈文强

陕西理工学院 生物科学与工程学院陕西 汉中 723000

陕西省食药用菌工程技术研究中心陕西 汉中 723000

邓百万

陕西理工学院 生物科学与工程学院陕西 汉中 723000

陕西省食药用菌工程技术研究中心陕西 汉中 723000

彭浩

陕西理工学院 生物科学与工程学院陕西 汉中 723000

陕西省食药用菌工程技术研究中心陕西 汉中 723000

解修超

陕西理工学院 生物科学与工程学院陕西 汉中 723000

陕西省食药用菌工程技术研究中心陕西 汉中 723000

赵娜娜

陕西理工学院 生物科学与工程学院陕西 汉中 723000

刘兆迪

陕西理工学院 生物科学与工程学院陕西 汉中 723000

乔艳明

陕西理工学院 生物科学与工程学院陕西 汉中 723000

张红涛

陕西理工学院 生物科学与工程学院陕西 汉中 723000

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中文摘要:

采用CTAB法提取黑木耳菌株的DNA,进行PCR扩增,扩增产物进行测序。耳2和标准菌株Auricularia auricula-judae HF-8(GQ168492)聚类在同一分支上;耳913和标准菌株Auricularia auricula-judae YBS-7(GQ168503)聚类在同一分支上,且神农A8与新科、耳2、耳913亲缘关系相对较远。耳97-2和标准菌株Auricularia auricula-judae NW482(EU520194)聚类在同一分支上;耳268和标准菌株Auricularia auricula-judae NW491(EU520160)聚类在同一分支上,且秦单4#与耳97-2、耳268亲缘关系相对较远。新科、耳2、耳913、神农A8此4个菌种亲缘关系比较近;耳268、秦单4#、耳97-2等3个菌种亲缘关系较近。通过黑木耳菌株的形态观察及ITS序列分析,得到两株亲缘关系较远的优势菌株秦单4#和神农A8。

英文摘要:

Analyzing the genetic relationships of the main Auricularia auricular cultispecies in Qinba mountainous area by ITS sequence so as to lay a theoretical foundation to genetics and breeding. Using CTAB method to extract genomic DNA from the bacterial strain, Auricularia auricular, and amplifying and sequencing PCR products; Auricularia auricula-judae 2 and Auricularia auricula-judae HF-8(GQ168492) were clustered in the same branch, Auricularia auricula-judae 913 and Auricularia auricula-judae YBS-7(GQ168503) were clustered in the same branch, but the genetic relationship between Auricularia auricula-judae Shennong A8 and the Auricularia auricula-judae 2, Auricularia auricula-judae 913 were relatively alienative. Auricularia auricula-judae 97-2, Auricularia auricula-judae NW482(EU520194), the Auricularia auricula-judae 268 and Auricularia auricula-judae NW491 (EU520160) were clustered in the same branch. However the genetic relationships among Auricularia auricula-judae Qindan 4, Auricularia auricula-judae 97-2, Auricularia auricula-judae 268 were relatively alienative. The genetic relationships among Auricularia auricula-judae Xinke, Auricularia auricula-judae 2, Auricularia auricula-judae 913 and Auricularia auricula-judae Shennong A8 were close. However, the relationships between Auricularia auricula-judae 268, Auricularia auricula-judae Qindan 4# and Auricularia auricula-judae 97-2 were quite far. Through the morphologic and ITS analysis of Auricularia auricular strains, two dominant strains, Auricularia auricula-judae Qindan 4# and Auricularia auricula-judae Shennong A8, have alienative relationship. Our findings established a solid foundation to genetics and breeding.

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