用非线性预测方法研究蛋白质序列的特性(Ⅰ)

Nonlinear Prediction Analysis of Properties in Protein Sequences(Ⅰ)

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中文关键词: 非线性预测方法 蛋白质序列 蛋白质分类 线性预测方法 研究 蛋白质 特征序列 特性 Sequences Protein Properties Analysis Prediction 对应 波动 曲线 发现 图形 比值 误差 结构类 主类 结构域

英文关键词:

基金项目:国家自然科学基金

管维红 徐振源 朱平

[1]江南大学信息工程学院,江苏无锡214122 [2]江南大学理学院,江苏无锡214122

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中文摘要:

通过详细HP模型将一条蛋白质序列构造为3个特征序列.其中蛋白质序列取自蛋白质分类数据库CATH,该库将蛋白质序列根据不同结构域分为4类(α主类,β主类,αβ类,低二级结构类).然后采用非线性预测方法,研究每类蛋白质序列的特征序列,得到特征序列的误差比值(E-D)图.从图形上发现,每类蛋白质序列的每条特征序列的曲线起伏波动不断,具有特异性,且4类蛋白质序列对应特征序列的E-D图之间也有很大不同.

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