| 鼠李糖乳杆菌JAAS8胞外多糖生物合成基因的克隆和序列分析
| Cloning and Sequence Analysis of the Exopolysaccharide Biosynthesis Genes from Lactobacillus rhamnosus JAAS8
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| DOI：
| 中文关键词: 鼠李糖乳杆菌 胞外多糖 生物合成 基因簇
| 英文关键词: Lactobacillus rhamnosus exopolysaccharide biosynthesis gene clusters
| 基金项目:国家自然科学基金项目(30670057);农业部现代农业产业技术体系建设专项资金项目(nycytx-0502)
| 作者
| 单位
| 戴大海
| 东北师范大学,生命科学学院,吉林,长春,130024
吉林省农业科学院,农产品加工研究中心,吉林,长春,130033
| 李盛钰
| 吉林省农业科学院,农产品加工研究中心,吉林,长春,130033
| 周义发
| 吉林省农业科学院,农产品加工研究中心,吉林,长春,130033
| 赵玉娟
| 吉林省农业科学院,农产品加工研究中心,吉林,长春,130033
| 张雪
| 吉林省农业科学院,农产品加工研究中心,吉林,长春,130033
| 曾宪鹏
| 吉林省农业科学院,农产品加工研究中心,吉林,长春,130033
| 杨贞耐
| 吉林省农业科学院,农产品加工研究中心,吉林,长春,130033
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| 中文摘要:
| 根据已报道乳杆菌胞外多糖生物合成基因的同源性,利用其保守区设计引物,扩增出鼠李糖乳杆菌JAAS8RmlA基因部分序列,并通过染色体步移法扩增出Rml(ACB)的序列。获得了鼠李糖乳杆菌JAAS8胞外多糖生物合成基因4.1 kb序列片段,编码4个可读框。利用BLAST和ClustalX程序对获得序列进行生物信息学分析,预测其结构和功能。结果表明:该序列与已知鼠李糖乳杆菌胞外多糖生物合成基因具有高度同源性,RmlA、RmlC和RmlB基因与dTDP-L-鼠李糖前体的生物合成密切相关。
| 英文摘要:
| To clone the RmlA gene in Lactobacillus rhamnosus JAAS8,degenerate primers were designed from the conserved domain of the exopolysaccharide biosynthetic genes of lactic acid bacteria(LAB).The distinctive PCR products with the expected size were amplified from L.rhamnosus JAAS8.The gene sequence(4.1 kb) of RmlACB and Orf1 were cloned by genomic walking method.Nucleotide sequence similarity analyses with GenBank sequences were performed using the BLAST and ClustalX software.GenBank database searching shows that the predicted protein products of the RmlACB genes from L.rhamnosus JAAS8 have highest similarity with the EPS biosynthetic genes of Lactobacillus.The genes RmlA、RmlC and RmlB are closely related to the biosynthesis of dTDP-L-rhamnose precursor.
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